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合作医疗和医保在多个方面存在显著差异，主要包括：
1、概念不同
合作医疗：全称新型农村合作医疗保险，是在群众自愿互助的基础上，依靠集体经济，在防病治病上实行互济互助的一种福利性质的医疗制度。它主要由我国农民自己创造，为农民的健康提供了一定的制度保障。
医保：通常指社会医疗保险，是国家和社会根据法律法规，在劳动者患病时基本医疗需求的社会保险制度。它不仅覆盖城镇职工，也逐步覆盖城镇居民和农村居民。
1、覆盖对象不同
合作医疗主要面向农村居民，且必须以家庭为单位整户参加。
医保则包括城镇职工基本医疗保险、城镇居民基本医疗保险等多种类型，覆盖更广泛的人群。
3、缴费方式不同
合作医疗是农民自愿参加的，费用由参保人个人负担。
医保中的城镇职工基本医疗保险费用则由用人单位和职工共同缴纳。
4、待遇不同
合作医疗主要提供医疗费用补助，保障农民的基本医疗需求。
医保除了提供医疗费用报销外，还可能包括个人账户费用门诊包干、住院医疗等更全面的待遇。
合作医疗的报销流程相对简单，主要包括以下几个步骤：
1、就医
参保人在市内定点医疗机构就诊时，可以直接在窗口刷卡报销。
若在市外2级及以上的公立医院就诊，需保留好就医资料和相关票据。
2、准备报销材料
门诊报销需携带门诊发票、合作医疗证历本(或病历)等。
住院报销需携带住院发票、合作医疗证历本(或病历)、费用明细清单、出院小结等。
特殊病种报销还需提供特殊病种合作医疗证历本、有关化验报告单等。
3、提交报销申请
参保人可将报销材料直接提交至区服务中心或乡镇卫生院合作医疗窗口。
也可将材料交给村(社区)合作医疗联络员，由其代为办理报销手续。
4、审核与兑付
合作医疗窗口工作人员会对提交的报销材料进行审核。
审核通过后，报销的费用会打到指定的银行账户中，或由窗口工作人员直接支付现金。
合作医疗和医保在概念、覆盖对象、缴费方式和待遇等方面存在显著差异。合作医疗作为农村居民的重要医疗保障制度，其报销流程相对简单明了，旨在为农民提供便捷、高效的医疗服务。
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